Berdirinya Perpustakaan Universitas ‘Aisyiyah Yogyakarta tidak lepas dari sejarah berdirinya Universitas ‘Aisyiyah (UNISA)Yogyakarta. Perpustakaan berkembang mengiringi perkembangan UNISA Yogyakarta. Sejarah telah mencatat bahwa embrio awal UNISA Yogyakarta berbentuk Sekolah Bidan ‘Aisyiyah Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Yogyakarta berdasarkan SK Menkes No 65 tanggal 10 Juli 1963. Kemudian dibuka pula Sekolah Panjenang Kesehatan Tingkat C ‘Aisyiyah Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Yogyakarta. Selanjutnya bertransformsi sebagai berikut.
Pada tahun 1978 Sekolah Panjenang dan Sekolah Bidan melebur menjadi Sekolah Perawat Bidan ‘Aisyiyah (SPB ‘A) Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Yogyakarta.Tahun 1980 SPB ‘A berubah menjadi Sekolah Perawat Kesehatan ‘Aisyiyah (SPK ‘A)Tahun 1982 dibuka Program Pendidikan Bidan ‘Aisyiyah (PPB ‘A) setingkat Diploma satu kebidanan Tahun 1991 SPK ‘A dikonversi menjadi Akademi Keperawatan ‘Aisyiyah Yogyakarta (AKPER ‘Aisyiyah) sesuai dengan SK Menkes RI No HK 00.06.1438 tanggal 6 Juli 1991.
Tahun 1998 AKPER ‘Aisyiyah dikonversi menjadi Akademi Kebidanan (AKBID) ‘Aisyiyah Yogyakarta sesuai dengan SK Menkes RI No HK 00.06.1.3.02187 Tahun 2003 AKBID ‘Aisyiyah Yogyakarta ditingkatkan statusnya menjadi SEKOLAH TINGGI ILMU KESEHATAN ‘AISYIYAH YOGYAKARTA sesuai dengan SK MENDIKNAS RI No 181/D/O/2003 tanggal 14 Oktober 2003 dengan Program Studi S1 Ilmu Keperawatan, Profesi Ners (Keperawatan) dan D3 Kebidanan. Pada tahun 2009 mulai dibuka Program Studi baru yaitu DIV Kebidanan Pendidik dengan SK ijin penyelenggaraan no 397/D/T/2009 tanggal 18 Juni 2009. Berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 66/E/O/2012 STIKES ‘Aisyiyah Yogyakarta menambah satu program studi yaitu prodi Fisioterapi S1. Berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia no 080/P/2014 STIKES ‘Aisyiyah Yogyakarta menambah satu program studi yaitu prodi Ilmu Kebidanan S2.
Tahun 2016, tepatnya pada tanggal 10 Maret 2016, STIKES ‘Aisyiyah Yogyakarta berubah bentuk menjadi Universitas ‘Aisyiyah (UNISA) Yogyakarta melalui Surat Keputusan (SK) Kemenristek Dikti nomor 109/KPT/I/2016. Sejak Maret 2016 itu pula berdirilah Perpustakaan UNISA Yogyakarta, yang disyahkan melalui Surat Keputusan yang dikeluarkan oleh Yayasan atau Badan Pembina Harian UNISA Yogyakarta. SK Pendirian Perpustakaan dengan Nomor. 05.1/PPA/I/BPH-UNISA/SK/III/2016. Pada saat itu perpustakaan menempati 3 lokasi, yaitu di Kampus 1, Jl. Munir No.267, Serangan, Ngampilan, Yogyakarta, di Kampus Terpadu UNISA Yogyakarta, di Asrama UNISA Yogyakarta. Selanjutnya pada bulan Mei 2020, seluruh perpustakaan dipusatkan dan berpindah ke Gedung C Kampus Terpadu UNISA Yogyakarta, dengan luas ruangan dan fasilitas yang lebih memadai.
Perpustakaan UNISA Yogyakarta dikelola oleh 5 pustakawan dengan latar belakang Pendidikan perpustakaan dan dikepalai oleh pustakawan berijazah S2 Ilmu Perpustakaan. Peningkatan kompetensi SDM selalu dilakukan baik dengan cara mengikuti magang, seminar, workshop, bimtek, dan sejenisnya. Hal ini mengantar Pustakawan UNISA Yogyakarta meraih prestasi sebagai Pustakawan Berprestasi Nasional, baik yang diadakan oleh Dikti maupun Perpustakaan Nasional RI.
Koleksi Perpustakaan UNISA Yogyakarta representative dan relefan untuk mendukung kebutuhan civitas akademika, baik berupa buku teks, AV, ebook, koleksi referensi, karya ilmiah, terbitan berkala, koleksi pendukung lainnya, dsb. ‘Aisyiyah Muhammadiyah Corner menjadi unggulan layanannya. Perpustakaan melanggan berbagai jurnal untuk semua prodi yang ada. Adapun ejournal yang dilanggan yaitu Proquest (tahun 2018-2019), Ebsco (mulai 2020), dan Journal of Midwifery and Womes Health, yang bisa diakses melalui link yang disediakan di website: lib.unisayogya.ac.id. Adapun koleksi digital hasil karya dosen dan mahasiswa dapat diakses melalui digilib.unisayogya.ac.id dan di digilib2.unisayogya.ac.id.
Layanan terbuka sangat memberi keleluasaan bagi pemustaka untuk memanfaatkan layanan yang ada didukung oleh sarana prasana yang memadai, baik meja, kursi, AC, ruang baca, ruang petugas, ruang koleksi, dll. Dukungan teknologi informasi, termasuk wifi internet yang bagus, SIM Perpustakaan, digital library, website, aplikasi ebook, dsb sangat mendukung semua kegiatan di perpustakaan. Berbagai layanan yang dsisediakan meliputi: layanan sirkulasi, referensi, penelusuran, baca di tempat, literasi informasi, silang layanan, foto kopi, penyediaan dokumen,layanan khusus, dll. Berbagai layanan selalu dipromosikan kepada pemustaka, termasuk pengadaan literasi informasi, publikasi koleksi terbaru, pameran, dsb. Untuk lebih memberikan layanan kepada pemustaka, Perpustakaan UNISA Yogyakarta menjalin kerja sama baik secara internal dengan unit lain yang ada di UNISA Yogyakarta maupun kerja sama dengan pihak eksternal lainnya. Salah satu jaringan kerja sama yang sangat kuat melalui Forum Perpustakaan Perguruan Tinggi Muhammadiyah ‘Aisyiyah (FPPTMA) telah menghasilkan banyak realisasi untuk bersinergi. Contohnya melalui hibah buku, peningkatan SDM, konsorsium institusional repository, pemberdayaan akses informasi, dsb.
Administrasi dan pendokumentasian dilakukan dengan tertata oleh Perpustakaan UNISA Yogyakarta, sehingga sangat membantu dalam pengelolaan perpustakaan. Hal ini terbukti dengan diperolehnya nilai akreditasi perpustakaan “A” pada periode lalu, dan selalu terpenuhinya semua komponen untuk akreditasi prodi dan institusi dari unsur perpustakaan. Perawatan koleksi dan seluruh sarana prasarana juga dilakukan untuk menjamin isi informasi yang ada dan inventaris semua barang yang ada agar lebih berdaya guna. Contohnya melalui stock opname, penyiangan, fumigasi, dsb. Dukungan pimpinan untuk pengembangan Perpustakaan UNISA Yogyakarta sangat bagus. Terbukti dengan ditetapkannya rata-rata pagu anggaran per tahun lebih dari 2 Milyar. Hal ini mendorong kreatifitas dan inovasi yang dihasilkan oleh perpustakaan, seperti berbagai layanan melaui QR Code, Library Awards, Perpus Bertadarus, disediakannya pojok kesehatan di perpustakaan, ebook berbasis aplikasi, dsb, yang mengantarkan Perpustakaan UNISA Yogyakarta meraih Jura 1 Lomba Inovasi Perpustakaan yang diadakan oleh FPPTI DIY tahun 2019.
Berbagai hasil karya pustakwan UNISA Yogakarta sebagai karya inovasi juga dapat dibaca melalui berbagai bentuk media cetak dan onlne, seperti dimuat di Majalah Gagasan BPPKI DIY, Buletin Cahaya UNIMMA, berbagai jurnal kepustakawanan, makalah Call for Paper, karya buku, dsb. Demikian pula dengan berbagai keunikan yang ada, seperti dimanfaatkannya pilar sebagai media promosi (ditempeli poster dilengkapi dengan batik khas UNISA, disediakannya display buku baru, dan adanya rak buku berbentuk kata iqro dalam tulisan Huruf Arab di pilar tersebut). Selain itu adanya Unisa Corner yang memuat informasi tentang semua Unisa yang ada di dunia ini. Untuk lebih memberikan fungsi peprustakaan yang tidak hanya sebagai tempat belajar dan sumber informasi, Peprustakaan UNISA Yogya juga menyediakan fun Corner, dengan menyediakan alat catur,rubik, VR (Virtual Reality, dsb). Demikian juga dengan menyediakan pojok baca di Ruang Admisi, dan membina Perpustakaan Sekolah Muhamamdiyah di wilayah sekitarnya.
Berbagai hal yang sudah diuraikan di atas, merupakan bentuk dan upaya yang terus dilakukan oleh Perpustakaan UNISA Yogyakarta untuk terus mengembangkan diri guna memberikan layanan yang berkualitas bagi pemustakanya. Tanggal 3 Juli 2021 Perpustakaan melakukan reakreditasi, dengan nilai A Kembali. Semua atas dukungan, bantuan, dan doa dari semua pihak baik inter dan ekstern.